Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D1P54289 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D1P54289 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms