Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GSK3BP49841 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms