Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM4P49221 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms