Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLD2P49005 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD2P49005 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms