Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDF5P43026 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDF5P43026 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GDF5P43026 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
GDF5P43026 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDF5P43026 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GDF5P43026 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GDF5P43026 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms