Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms