Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPC1P35052 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms