Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CASQ1P31415 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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CASQ1P31415 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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