Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNMT1P26358 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms