Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PTX3P26022 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms