Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCEA1P23193 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA1P23193 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms