Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NTF3P20783 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NTF3P20783 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NTF3P20783 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NTF3P20783 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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