Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATF1P18846 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATF1P18846 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATF1P18846 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATF1P18846 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms