Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRAP18433 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRAP18433 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRAP18433 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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