Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF3P17036 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms