Protein–RNA interactions for Protein: P11717

IGF2R, Cation-independent mannose-6-phosphate receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2RP11717 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGF2RP11717 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms