Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms