Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4BP0C0L5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4BP0C0L5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4BP0C0L5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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