Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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