Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRATO95237 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRATO95237 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms