Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC24DO94855 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms