Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms