Protein–RNA interactions for Protein: O75191

XYLB, Xylulose kinase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XYLBO75191 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XYLBO75191 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XYLBO75191 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XYLBO75191 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms