Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCN2BO60939 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms