Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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