Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms