Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNJ2O15056 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNJ2O15056 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms