Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBXN8O00124 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBXN8O00124 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms