Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms