Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA3F8WFD2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms