Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E9PBE3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E9PBE3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E9PBE3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms