Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF316A6NFI3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms