Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A087WUJ7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms