Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD54L2Q9Y4B4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms