Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REXO2Q9Y3B8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms