Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms