Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAK1Q9UPV9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms