Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMCC3Q9ULS5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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TMCC3Q9ULS5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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TMCC3Q9ULS5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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