Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms