Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms