Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms