Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC180Q9P1Z9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms