Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RLIMQ9NVW2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms