Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCIQ9NVI1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCIQ9NVI1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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