Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 216.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 144.8
UTP3Q9NQZ2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 ASH2L-203ENST00000517496 2194 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 ASH2L-207ENST00000521652 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-209ENST00000441192 1224 ntTSL 516.6■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-210ENST00000472912 2629 ntTSL 215.19■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-208ENST00000433289 1618 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.68e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-212ENST00000474428 742 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-210ENST00000470975 638 ntTSL 211.71□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 144.7
UTP3Q9NQZ2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.129e-7■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 DDX55-212ENST00000544738 956 ntTSL 517.09■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 DDX55-202ENST00000354291 1004 ntTSL 516.75■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 DDX55-209ENST00000542286 2767 ntTSL 216.22■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 DDX55-206ENST00000539934 2240 ntTSL 515.37■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 CEP95-203ENST00000556440 3139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 CEP95-202ENST00000553956 2669 ntTSL 1 (best)4.39□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.255e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.785e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 324.39■■□□□ 1.495e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 524.01■■□□□ 1.435e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 517.85■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 216.88■□□□□ 0.295e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 315.85■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 ARIH1-209ENST00000567762 319 ntTSL 37.12□□□□□ -1.275e-13■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 SMC1A-204ENST00000463684 880 ntTSL 215.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 144.6
UTP3Q9NQZ2 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 48.13□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.021e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.641e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-211ENST00000530340 1876 ntTSL 1 (best)23.81■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-204ENST00000393352 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-210ENST00000452732 886 ntTSL 211.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 144.5
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.51■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 RSF1-208ENST00000530604 520 ntTSL 218.45■□□□□ 0.545e-13■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 AKT1-217ENST00000557494 408 ntTSL 223.4■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.156e-7■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.87e-8■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 PLAGL1-210ENST00000493898 505 ntTSL 37.69□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 144.4
UTP3Q9NQZ2 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 513.35□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-217ENST00000523114 579 ntTSL 419.69■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-216ENST00000522959 556 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-219ENST00000524192 980 ntTSL 215.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 SNU13-202ENST00000355257 1503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 144.3
UTP3Q9NQZ2 SETD3-203ENST00000357563 2191 ntTSL 522.8■■□□□ 1.242e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SETD3-206ENST00000453764 973 ntTSL 520.64■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 EHMT1-244ENST00000637655 100 ntTSL 515.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 SETD3-205ENST00000446066 1754 ntTSL 513.19□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 EHMT1-229ENST00000636081 100 ntTSL 54.48□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-201ENST00000340490 1774 ntTSL 1 (best)26.66■■□□□ 1.861e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-212ENST00000525583 1066 ntTSL 523.62■■□□□ 1.371e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 PDIA2-204ENST00000456379 680 ntTSL 523.16■■□□□ 1.33e-18■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-208ENST00000480946 1199 ntTSL 519.95■□□□□ 0.781e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-210ENST00000491904 641 ntTSL 319.45■□□□□ 0.71e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-214ENST00000532645 866 ntTSL 518.88■□□□□ 0.611e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.532e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 NAPRT-206ENST00000462059 722 ntTSL 218.28■□□□□ 0.521e-14■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-209ENST00000573554 606 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.442e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 DOT1L-208ENST00000591498 567 ntTSL 414.64□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.54e-11■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-208ENST00000572008 797 ntTSL 510□□□□□ -0.812e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-21■■■■■ 144.2
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC8.48□□□□□ -1.052e-13■■■■■ 144.2
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1304.3 ms