Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC35C2Q9NQQ7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms