Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRIP3Q9NQ35 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms