Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
A4GALTQ9NPC4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms