Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms