Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LNPKQ9C0E8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms